Daerah Aliran Sungai ( DAS ) :
Wilayah Kajen, Kab. Pekalongan terdapat aliran sungai yang berfungsi sebagai sarana pengairan pertanian dan tidak untuk sarana perhubungan lalu lintas karena pada umumnya kondisi sungai tidak begitu lebar dan mudah diseberangi dengan perahu kecil serta arus air yang kecil, namun setiap tahunnya sepanjang daerah aliran sungai sering terjadi banjir khususnya pada musim penghujan. Sungai sungai dimaksud adalah :
- Sungai Sragi sepanjang 65 Km yang melalui wilayah Kec. Kandangserang, Kajen, Kesesi, Bojong dan Sragi.
- Sungai Sengkarang ( Pencongan ) sepanjang 52 Km melalui wilayah Kec. Petungkriyono, Lebakbarang, Doro, Karanganyar, Wonopringgo, Kedungwuni, Tirto dan Wiradesa.
- Sungai Layangan ( anak sungai Genteng ) sepanjang 19,25 Km melalui wilayah Kandangserang – Paninggaran
- Sungai Kupang ( Pekalongan ) sepanjang 15,50 Km melalui wilayah Talun - Buaran